（一）综合部。负责文电、信息、档案、保密、机要、会务、案卷管理、文字综合、后勤管理、信息系统开发维护等工作；负责机构编制、人事管理和离退休干部服务等工作；负责财务管理、资产管理、政府采购、财务审计等工作；负责党的组织建设、宣传教育、思想工作、意识形态、精神文明建设等党务工作；负责纪检、监察工作；负责工会、共青团、妇联等群团工作。综合部部长吕继开。

（二）立案部。负责民商事纠纷仲裁案件立案审查、登记、受理、案件编号、立案缴费和退费手续等工作；负责仲裁法律法规咨询；负责为当事人协调财产保全、证据保全等服务工作；负责案件流程管理工作；负责立案大厅及服务区域的日常管理和维护工作。立案部部长英勇。

（三）审理部。负责办案秘书、速录员管理、负责庭前调解、庭审记录、仲裁文书制作、订卷归档、庭审材料收集和送达、仲裁员劳务费报批等工作；负责处理技术开发与转让、经济、技术、建设工程、房地产交易、土地使用权转让、产品质量责任、交通运输、计算机信息技术等方面合同纠纷和其他财产权益纠纷仲裁案件工作；负责协助调查取证、委托鉴定和鉴定机构管理工作。审理部部长于成桓。

（四）案监部。组织专家咨询论证、理论与实践研究工作；负责仲裁案件监督、评价工作；负责仲裁员的培训管理和联络工作；负责仲裁相关法律法规的宣传和调研工作；负责信访工作。案监部部长张彤军。

（五）沈阳国际仲裁院（沈阳国际调解中心）：负责处理国际贸易与投资、股权转让、金融、保险、期货、证券、融资租赁、金融衍生品交易等方面合同纠纷和其他财产权益纠纷仲裁案件工作；负责仲裁制度推广和业务拓展工作；负责国际商事调解工作；负责官网和公众号维护及网络安全工作。沈阳国际仲裁院（沈阳国际调解中心）院长（主任）曹旭。

（六）沈阳知识产权仲裁院（中德产业园知识产权仲裁院）：负责受理国内外的著作权、商标权、专利权及其他知识产权合同纠纷，并根据相关仲裁规则组织审理并作出裁决；负责提供涉及知识产权合同纠纷的法律咨询服务工作；负责知识产权仲裁法律制度宣传推广工作。沈阳知识产权仲裁院（中德产业园知识产权仲裁院）院长王欢。